Der Tipp mit dem Radiergummi ist schon die beste Möglichkeit. Das Problem ist einfach, dass ein Kugelschreiber das Papier mechanisch beansprucht, sprich eindrückt und zusätzlich Tinte nicht nur an der Oberfläche haftet sondern in der Regel auch ein Stück in die Papierfasern eindringt. Daher ist eine vollständige Entfernung normalerweise nicht machbar.
Bei Permanentmarkern (Edding etc.) und Einsatz von Alkohol kann der Zustand in der Tat danach schlimmer als vorher sein. Insbesondere bei nichtversiegelter Oberfläche (also nicht laminiert) löst man mit dem Alkohol die Farbe des Stiftes u.U. an und verschmiert sie anschließend . Das sieht dann eher schlimmer als besser aus.
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